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Genomas agrícolas impulsan productividad y competitividad del campo mexicano

Genomas agrícolas impulsan productividad y competitividad del campo mexicano

Activo lunes 05 de septiembre de 2022 -

• Con el apoyo de la Secretaría de Agricultura y Desarrollo Rural y del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología, se logró descifrar los genomas de cultivos considerados estratégicos, los cuales se entregaron oficialmente al secretario de Agricultura, Víctor Villalobos Arámbula.

Redacción


México es uno de los cinco países con mayor diversidad biológica del mundo, marco en el cual el Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad (Langebio) logró secuenciar al 100 por ciento el genoma del agave, limón, papaya, vainilla y zarzamora, así como de genomas vegetales de plantas que presentaban mayor dificultad para la obtención de ADN de buena calidad.

Con el apoyo de la Secretaría de Agricultura y Desarrollo Rural y del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología, el Langebio logró descifrar los genomas de estos cultivos, los cuales se entregaron oficialmente al titular de Agricultura, Víctor Villalobos Arámbula como parte del proyecto "Integración Genómica para la caracterización y Mejoramiento de Cultivos Estratégicos para México”.

Esto, además, contribuirá a impulsar la productividad del campo mexicano, la competitividad de los productores y abonará a la meta de alcanzar la seguridad alimentaria del país.

El Laboratorio forma parte del Centro de Investigación y de Estudios Avanzados (Cinvestav) Campus Irapuato del Instituto Politécnico Nacional (IPN), y tiene el objetivo de desarrollar investigación, difusión, formación de recursos humanos y de ofrecer servicios tecnológicos para la preservación y aprovechamiento sustentable de la biodiversidad biológica del país.

Los estudiantes que realizan su tesis de maestría o doctorado con los investigadores del Laboratorio forman automáticamente parte de los programas de posgrado con los que cuenta el campus, como el Programa en Biotecnología de Plantas, en donde los alumnos son instruidos en el manejo de métodos y tecnologías aplicadas al sector agrícola e industrial para el aprovechamiento sustentable de la biodiversidad, y otro es el Programa en Biología Integrativa en el que son capacitados para generar soluciones multidisciplinarias a problemas biológicos de carácter científico.

Debido a sus programas avanzados de investigación y tecnología de primer nivel y a los servicios de secuenciación, protección y análisis de genomas del Langebio, el país contará con mayor información para identificar y generar nuevas variedades de importancia prioritaria, indispensables para garantizar mejores rendimientos de los cultivos y agroalimentos de mayor calidad para los consumidores.

El director de la Unidad de Genómica Avanzada del Cinvestav, Alfredo Herrera Estrella, señaló que, lo que permitirá enfrentar de manera adecuada las problemáticas presentadas en el contexto actual del campo son la generación de genomas de referencia para todos los cultivos que no cuenten con uno adecuado, la identificación de todos los genes existentes para cada uno de ellos, y generar datos masivos de variantes de las colecciones disponibles, tanto de variedades élite como de germoplasma silvestre.

El experto detalló que el proyecto determinó cuáles serían los materiales de cada cultivo más adecuados para la secuenciación de su genoma, se colectaron muestras de hojas, tallo, raíz, flor y fruto para la obtención de RNA para análisis transcriptómico, y se llevó a cabo la secuenciación de una mezcla de RNAs de múltiples tejidos para frijol, café, papaya, vainilla y zarzamora utilizando la plataforma Illumina, en todos los casos, excepto en el del limón, para el cual se utilizó la plataforma MGI.

Una vez que se tuvieron los datos de secuenciación, se construyó una plataforma web para el acceso a los datos biológicos generados, la cual, consta de siete bases de datos que almacenan información de cada usuario, accesiones, variedades, así como los 11 bases de datos genómicos de los cultivos procesados en el proyecto que son, Agave tequilana, Capsicum annuum, Carica papaya, Citrus arantifolia, Coffea arabica, Coffea canephora, Coffea eugenioides, Persea americana, Phaseolus vulgaris, Rubus ulmifolius y Vanilla planifolia.


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JA/CR

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